Учебно-методический центр по ГО и ЧС Калининградской области создан решением суженного заседания облисполкома от 6 февраля 1965г. № 05 на основании Постановления Советов Министров РСФСР от 10 декабря 1964 г. №1536-168 и директивы начальника ГО СССР от 15 мая 1964 г. №2/1196287 С как 325 курсы ГО Калининградской области.
Приказом начальника штаба по делам ГО и ЧС Калининградской области от 29 сентября 1993 г. №148 на основании директивы Председателя Государственного комитета РФ по делам ГО и ЧС от 23 июля 1993г. №201/809, с 1 октября 1993 г. 325 курсы ГО Калининградской области переименованы в 325 учебно-методический центр по ГО и ЧС Калининградской области.
Директивой МЧС России №31-18-21/325 от 25 июля 2000 г. учебно-методическому центру присвоен новый номер - 1268 УМЦ по ГО и ЧС Калининградской области.
Постановлением администрации Калининградской области № 398 17 июля 2003 г. на базе 1268 УМЦ по ГО и ЧС и курсов ГО г. Калининграда создано Государственное образовательное учреждение дополнительного профессионального образования (повышения квалификации) специалистов «Учебно-методический центр по гражданской обороне и чрезвычайным ситуациям Калининградской области».
Постановлением Правительства Калининградской области от 25 апреля 2008 г. № 246 «О ведомственной подчиненности отдельных государственных учреждений Калининградской области» установлена ведомственная подчиненность УМЦ по ГО и ЧС Калининградской области Правительству Калининградской области и УМЦ передан в управление Главного управления МЧС России по Калининградской области в соответствии с Соглашением между МЧС России и Правительством Калининградской области».
Постановлением Правительства Калининградской области от 3 мая 2011 года № 293 «Об установлении ведомственной подчиненности Государственного образовательного учреждения дополнительного профессионального образования (повышения квалификации) специалистов «Учебно-методический центр по гражданской обороне и чрезвычайным ситуациям Калининградской области» передан в ведомственное подчинение Министерству образования Калининградской области.
Постановлением Правительства Калининградской области от 10 февраля 2016 года № 12-рп «О реорганизации отдельных государственных учреждений Калининградской области» реорганизовано государственное бюджетное учреждение Калининградской области «Отряд государственной противопожарной службы и обеспечения мероприятий гражданской обороны» и государственное бюджетное образовательное учреждение дополнительного профессионального образования (повышения квалификации) специалистов «Учебно-методический центр по гражданской обороне и чрезвычайным ситуациям Калининградской области» в форме присоединения государственного бюджетного образовательного учреждения дополнительного профессионального образования (повышения квалификации) специалистов «Учебно-методический центр по гражданской обороне и чрезвычайным ситуациям Калининградской области» к государственному бюджетному учреждению Калининградской области «Отряд государственной противопожарной службы и обеспечения мероприятий гражданской обороны».
Приказом начальника государственного бюджетного учреждения Калининградской области «Отряд государственной противопожарной службы и обеспечения мероприятий гражданской обороны» от 25 мая 2016года № 41 создано структурное подразделение «Учебно-методический центр по гражданской обороне и чрезвычайным ситуациям Калининградской области».
