20 декабря 1996 года, в соответствии с Гражданским кодексом Российской Федерации, Федеральным законом «О некоммерческих организациях», Федеральным законом «О защите населения и территорий от чрезвычайных ситуаций природного и техногенного характера», Федеральным законом «О гражданской обороне», Законом Российской Федерации «Об образовании», иными законами и нормативными правовыми актами РФ, Ямало-Ненецкого автономного округа, регламентирующими деятельность образовательных учреждений дополнительного образования, на территории Ямало-Ненецкого автономного округа было создано учреждение Курсы гражданской обороны Ямало-Ненецкого автономного округа. Курсы были размещены в муниципальном образовании г. Ноябрьск по улице Изыскателей, дом 21б. А с апреля 1997 года по адресу г. Ноябрьск, ул. Шевченко, дом 56.
Курсы ГО ЯНАО - это государственное учреждение. Учредителем курсов ГО ЯНАО являлась Администрация Ямало-Ненецкого автономного округа, и содержались курсы за счет средств учредителя. Слушателями курсов ГО являлись лица, направленные в установленном порядке на обучение органом исполнительной власти автономного округа, органами местного самоуправления, учреждениями, организациями и предприятиями ЯНАО. Штатная численность курсов ГО определялась учредителем с учетом рекомендаций МЧС России и составляла 9 человек. Непосредственное руководство деятельностью курсов ГО ЯНАО осуществлял начальник курсов ГО ЯНАО - Гладких Виктор Леонидович. Штатная численность курсов - 9 человек.
Изначально учебно-методическая база курсов ГО была несовершенной. Оформлением учебных классов, изготовлением стендов, макетов, учебных плакатов занимался весь преподавательский состав. Постепенно приобретались технические средства обучения, приборы, наглядные и учебные пособия, литература, предназначенные для эффективной подготовки и повышения квалификации слушателей.
В соответствии с Постановлением Губернатора ЯНАО № 340 от 26 августа 2003 года учреждение - Курсы по гражданской обороне и чрезвычайным ситуациям ЯНАО были преобразованы в Учебно-методический центр по гражданской обороне и чрезвычайным ситуациям Ямало-Ненецкого автономного округа.